六年三月，诏群臣集议方略。工尚书江渊等请用官军五万以浚运。有贞恐役军费重，请复陈瑄旧制，置捞浅夫，用沿河州县民，免其役。

置闸，开分河，挑运河。

隆庆元年正月，衡请罢上源议，惟开广秦沟，筑南长堤。五月，新河成，西去旧河三十里。旧河自留城以北，经谢沟、下沽、中沽、金沟四闸，过沛县，又经庙、湖陵城、孟、八里湾、谷亭五闸，而至南闸。新河自留城而北，经家桥、西柳庄、满家桥、夏镇、杨庄、硃梅、利建七闸，至南闸合旧河，凡百四十里有奇。又引鲇鱼诸泉及薛河、沙河注其中，而设坝于三河之，筑家桥堤，遏黄秦沟，运乃大通。未几，鲇鱼山暴决，没漕艘。帝从衡请，自东邵开支河三以分之，又开支河于东邵之上，历东沧桥以达百中桥，凿豸里沟诸为渠，使赤山湖，由之以归吕孟湖，下境山而去。

弘治二年，河复决张秋，冲会通河，命侍郎白昂相治。昂奏金龙决已淤，河并为一大支，由祥符合沁下徐州而去。其间河浅隘，宜于所经七县，筑堤岸以卫张秋。下工议，从其请。昂又以漕船经邮甓社湖多溺，请于堤东开複河西四十里以通舟。越四年，河复决数运河，坏张秋东堤，夺汶海，漕绝。时工侍郎陈政总理河，集夫十五万，治未效而卒。

六年，副都御史刘大夏奉敕往治决河。夏半，漕舟鳞集，乃先自决西岸凿月河以通漕。经营二年，张秋决就，复筑黄陵冈上。于是河复南下，运无阻。乃改张秋曰安平镇，建庙赐额曰显惠神祠，命大学士王鏊纪其事，勒于石。而白昂所开邮複河亦成，赐名康济，其西岸以石甃之。又甃邮堤，自杭家闸至张家镇凡三十里。邮堤者，洪武时所筑也。陈瑄因旧增筑，延及宝应，土人相沿谓之老堤。正统三年易土以石。成化时，遣官筑重堤于邮、邵伯、宝应、白四湖老堤之东。而王恕为总河，修淮安以南诸决堤，且浚淮、扬漕河。重湖壖民盗决溉田之罚，造闸〈石达〉以储湖。及大夏张秋，而昂又开康济，漕河上下无大患者二十馀年。

徐、吕二洪者，河漕咽也。自陈瑄凿石疏渠，正统初，复浚洪西小河。漕运参将汤节又以洪迅败舟，于上筑堰，归月河，河南建闸以蓄势。成化四年，河主簿郭升以大石筑两堤，锢以铁锭，凿外洪败船恶石三百，而平筑里洪堤岸，又甃石岸东西四百馀丈。十六年增甃吕梁洪石堤、石坝二百馀丈，以资牵挽。及是建闸，行者益便之。

诸大臣多治河议。詹事霍韬谓：“前议役山东、河南丁夫数万，疏浚淤沙以通运。然沙随下，旋浚旋淤。今运舟由昭湖鸣台至沙河，迂回不过百里。若沿湖筑堤，浚为小河，河为闸，以待蓄，溢可避风涛，涸易为疏浚。三月而土堤成，一年而石堤成，用力少，取效速。黄河愈溢，运愈利，较之役丁夫以浚淤土，劳逸大不侔也。”尚书李承勋谓：“于昭湖左别开一河，引诸泉为运，自留城沙河为尤便。”与都御史胡世宁议合。七年正月，总河都御史盛应期奏如世宁策，请于昭湖东凿新河，自汪家南留城，长百四十里，刻期六月毕工。工未半，而应期罢去，役遂已。其后三十年，朱衡始循其遗迹，浚而成之。是年冬，总河侍郎潘希会加筑济、沛间东西两堤，以拒黄河。

衡召为工尚书，都御史翁大立代，上言：“漕河资泉，而地形东西下，非湖潴之则涸，故漕河以东皆有柜；非湖之则溃，故漕河以西皆有壑。黄逆奔，则以昭湖为散漫之区；山东突，则以南湖为潴蓄之地。宜由回回墓开通以达鸿沟，令谷亭、湖陵之皆昭湖，即浚鸿沟废渠，引昭湖沿渠东留城。其湖地退滩者，又可得田数千顷。”大立又言：“薛河湍悍，今尽注赤山湖，微山湖以达吕孟湖，此尚书衡成绩也。

成化七年，又因廷议，分漕河沛县以南、德州以北及山东为三，各委曹郎及监司专理，且请简风力大臣总理其事。始命侍郎王恕为总河。二十一年敕工侍郎杜谦浚运，自通州至淮、扬，会山东、河南抚相度经理。

十九年七月，河决野冈，二洪涸。督理河漕侍郎王以旂请浚山东诸泉以济运，且筑长堤聚，如闸河制。遂清旧泉百七十八，开新泉三十一。以旂复奏四事。一请以诸泉分隶守土官兼理其事，毋使堙。一请于境山镇、徐、吕二洪之下，各建石闸，蓄数尺以行舟，旁留月河以暴汛；筑四木闸于武家沟、小河、石城、匙湾，而置方船于沙坊等浅，以备捞浚。一言漕河两岸有南旺、安山、场、昭四湖，名为柜，所以汇诸泉济漕河也。豪侵占，蓄不多，而昭一湖淤成地，大非国初设湖初意。宜委官清理，添置闸、坝、斗门，培筑堤岸，多开沟渠，浚河底，以复四柜。一言黄河南徙，旧闸俱，惟孙继一独存。导河徐州小浮桥，下徐、吕二洪，此济运之大者。请于孙继多开一沟，及时疏瀹，庶二洪得济。帝可其奏，而以泉专责之曹。

世宗之初，河数坏漕。嘉靖六年，光禄少卿黄绾论泉源之利，言：“漕河泉源皆发山东南旺、场、樊村、安山诸湖。泉所钟，亟宜修浚，且引他泉并蓄，则漕不竭。南旺、场堤外孙村地洼，若潴为湖，改作漕，尤可免济宁原浅涩之苦。”帝命总河侍郎章拯议。而拯以黄运，运船阻沛上，方为御史吴仲所劾。拯言：“河难遽通，惟金沟迤北新冲一渠可令运船由此昭湖，沙河板桥。其先阻浅者，则西历冢寺，庙北通行。下并议，未决。给事中张嵩言：“昭湖地庳，河势，引河湖，必致弥漫，使湖复阻。请罢拯，别推大臣。”议如嵩言。拯再疏自劾，乞罢，不许。卒引运船湖中。其冬，诏拯还京别叙，而命择大臣督理。

五月，浚漕工竣。七月，沙湾决工亦竣，会通复安。都御史陈泰一浚淮、扬漕河，筑置坝。黄河尝新庄闸至清江浦三十馀里，淤浅阻漕，稍稍浚治，即复其旧。英宗初，命官督漕，分济宁南北为二，侍郎郑辰治其南，副都御史贾谅治其北。

十六年，巡抚徐源言：“济宁地最，必引上源洸以济，其在堈城石濑之上。元时治闸作堰，使尽南旺，分济南北运。成化间，易土以石。夫土堰之利，小则遏以洮，大则闭闸以防沙壅，听其漫堰西。自石堰成，遂横溢，石堰既坏，民田亦冲。洸河沙，虽有闸门，压不能启。乞毁石复土，疏洸壅以至济宁，而筑堈城迤西城决岸。”帝命侍郎李遂往勘，言：“堈城石堰，一可遏淤沙，不为南旺湖之害，一可杀势，不虑村坝之冲，不宜毁。近堰积沙，宜浚。堈城稍东有元时旧闸，引洸济宁，下接徐、吕漕河。东平州村，则汶海故也。自永乐初，横筑一坝，遏汶南旺湖，漕河始通。今自分龙王庙至天井闸九十里，三丈有奇，若洸河更浚而，则汶尽向济宁而南，临清河必涸。洸不可浚。堈城至柳泉九十里，无关运，可弗事。柳泉至济宁，汶、泗诸会，宜疏者二十馀里。城，外障汶，内防民田，堤卑岸薄，宜与村坝并修筑。”从之。正德四年十月，河决沛县飞云桥，运。寻。

四十四年七月，河大决沛县，漫昭湖，由沙河至二洪，浩渺无际，运淤百馀里。督理河漕尚书朱衡循览盛应期所凿新河遗迹，请开南、留城上下。总河都御史潘季驯不可。衡言：“是河直秦沟，有所束隘。伏秋黄盛，昭受之，不为壑也。”乃决计开浚，自督工，重惩不用命者。给事中郑钦劾衡故兴难成之役，民幸功。朝廷遣官勘新旧河孰利。给事中何起鸣勘河还，言：“旧河难复有五，而新河之难成者亦有三。顾新河多旧堤阜，黄难侵，睃而通之，运必利。所谓三难者，一以夏村迤北地，恐难接，然地势低，大约不过二丈，一视平加，何患浅。一以三河积沙厚，势湍急，不无阻，然建坝拦截，岁一挑浚之，何患沙壅。一以家桥筑堤，微山取土不便，又恐投埽，势必不，然使委任得人，培筑厚，无必不可措力之理。开新河便。”下廷臣集议，言新河已有次第，不可止。况百中桥至留城白洋浅，境山，疏浚补筑，亦不全弃旧河，群议俱合。帝意乃决。时大雨，黄骤发，决家桥，坏新筑东西二堤。给事中王元、御史黄襄皆劾衡欺误，起鸣亦变其说。会衡奏新旧河百九十四里俱已通，漕船至南无滞。诏留衡与季驯详议开上源、筑长堤之便。