二十四年秋，辅以河南地在上游，河南有失，则江南河淤淀不旋踵。乃筑考城、仪封堤七千九百八十九丈，封丘荆隆大月堤三百三十丈，荥埽工三百十丈，又凿睢宁南岸龙虎山减闸四。上念邮诸州湖溢淹民田，命安徽察使于成龙修治海及下河，听辅节制。旋召辅、成龙至京集议。成龙力主开濬海；辅言下河海内地五尺，应筑长堤丈六尺，束趋海。所见不合，下廷臣议，亦各持一说。上以讲官乔莱江北人，召问，莱言辅议非是。因遣尚书萨穆哈等勘议，还言开海无益。会江宁巡抚汤斌为尚书，询之，斌言海开则积可，惟邮、兴化民虑毁庐墓为不便耳。乃黜萨穆哈，颁内帑二十万，命侍郎孙在丰董其役。时又有督修下河宜先减坝之议，上不许。召辅对，辅言南坝永，恐淮弱不敌黄，宜于家堰外增筑重堤，截清不下河，停丁溪等工程。成龙时任直抚，示以辅疏，仍言下河宜濬，修重堤劳费无益。议不决。复遣尚书佛等勘议，佛主辅议。二十七年，御史郭琇劾辅治河无绩，内外臣工亦章论之，乃停筑重堤，免辅官，以闽浙总督王新命代之，仍督修下河，镌在丰级，以学士凯音布代之。

明年，上南巡，阅家堰，谓诸臣曰：“此堤颇固，然亦不可无减坝以防大冲决。但靳辅于旧堤外更筑重堤，实属无益。”并以辅于险工修挑坝，令势回缓，甚善。车驾还京，复其官。三十一年，新命罢，仍令辅为河督。辅以衰疾辞，命顺天府丞徐廷玺副之。辅请于黄河两岸值柳草，多设涵，俱报可。是冬，辅卒，上闻，叹悼，予骑都尉世职。以于成龙为河督。

泥浅尽淤，今洪泽湖底渐成平陆矣。河既垫若此，而黄裹沙之自西北来，昼夜不息，一至徐、邳、宿、桃，即缓弱散漫。臣目见河沙无日不积，河无日不加，若不大修治，不特洪泽湖渐成陆地，将南而运河，东而清江浦以下，淤沙日甚，行见三面壅遏，而河无去路，势必冲突内溃，河南、山东俱有沦胥沈溺之忧，彼时虽费千万金钱，亦难剋期补救。”因分列大修事宜八：曰取土筑堤，使河宽；曰开清及烂泥浅引河，使得引淮刷黄；曰加筑家堰堤岸；曰周桥闸至翟家坝决三十四，须次第堵；曰挑清至清潭运，增培东西两堤；曰淮扬田及商船货，酌纳修河银；曰裁并河员以专责成；曰里设兵，画堤分守。廷议以军务未竣，大修募夫多，宜暂停。疏再上，惟改运土用夫为车运，馀悉如所请。

三年六月，决睢宁硃家海，东注洪泽湖。明年四月，未竣，河陡涨，冲塌东岸坝台，睢宁、虹、泗、桃源、宿迁悉被淹，命两广总督孔毓珣驰勘协防，十二月。是月河清，起陕西府谷讫江南桃源。五年，齐苏勒以硃家海素称险要，增筑夹坝月堤、防风埽，并于大溜冲削陡岸为斜坡，悬密叶大柳于坡上，以抵溜之汕刷。久之，大溜归中泓，柳枝沾挂泥滓，悉成沙滩，易险为平，工不劳而费甚省。因请凡河崖陡峻，俱仿此行。六年，曾筠内迁礼尚书，副总河如故，命署广东察使尹继善协理江南河务。

大修至是已三年，河未尽复故，辅自劾。议褫职，上命留任。二十一年，决宿迁徐家湾，随。又决萧家渡。先是河仅一线，辅尽堵杨家庄，束刷之，而引河浅窄，淤刷鼎沸，遇徐家湾堤卑则决，萧家渡土松则又决。会候补布政使崔维雅上河防刍议，条列二十四事，请尽变辅前法。上遣尚书伊桑阿、侍郎宋文运履勘，命维雅随往。维雅尽毁减坝，别图挑筑。伊桑阿等言辅所建工程固多不，改筑亦未必成功。辅亦申辨“工将次第告竣，不宜有所更张”并下廷议。因召辅至京，辅言“萧家明正可，维雅议不可行”上是之，命还工。二十二年，萧家渡，河归故。明年，上南巡阅河，赐诗褒。

六十年八月，决武陟詹家店、营、魏家，大溜北趋，注县、长垣、东明，夺运河，至张秋，由五空桥盐河归海。自河工告成，黄顺轨，安澜十馀年矣，至是遣鹏翮等往勘。九月，詹家店、魏家；十一月，营。世显罢，以陈鹏年署河总督。六十一年正月，营复决，张秋，奔注大清河。六月，沁暴涨，冲塌秦家厂南北坝台及钉船帮大坝。时王家沟引河成，引溜由东南会荥泽正河，营堤因无恙。鹏年复于广武山官庄峪挑引河百四十馀丈以分势。九月，秦家厂南坝甫，北坝又决，营亦漫开；十二月，之。

七年，改河总督为江南河总督，驻清江，以孔毓珣任，省副总河。以曾筠为山东河总督，驻济宁。上以明臣潘季驯有每岁派夫加堤五寸之议，前靳辅亦以为言，计岁费不过三四万，下两河总督议。毓珣等请酌缓急，分年加倍，约岁需二万馀金，下议行。八年，毓珣卒，曾筠调督南河，田文镜兼署东河总督。五月，敕建河州外河源神庙成，加封号。是月，河清，起积石关讫撒喇城查汉斯。是

明年，成龙卒，以两江总督张鹏翮为河督。是岁时家，从鹏翮先疏海之请，尽拆云梯关外拦黄坝，赐名大清；建宿迁北岸临黄外石闸，徐州南岸杨家楼至段家庄月堤。四十一年，上谓永定河石堤甚有益，推行黄河两岸，自徐州至清皆修石堤。鹏翮言“建筑石工，必地基实。惟河靡常，沙土松浮，石堤工繁费钜，告成难以预料”遂作罢。四十二年，上南巡，阅视河工，制河臣箴以赐鹏翮。秋，移建中河于杨家楼，溜南趋，清暢敌黄，海大通，河底日，黄不虞倒。上嘉鹏翮绩，加太太保。四十六年八月，决丰县吴家庄，随。明年，鹏翮为刑尚为，以赵世显代之。四十八年六月，决兰雷家集、仪封洪邵湾及驿张家庄各堤。

雍正元年六月，决中牟十里店、娄家庄，由刘家寨南贾鲁河。会鹏年卒，齐苏勒为总河，虑贾鲁河下注之，山盱、堰临湖堤工不能容纳，亟宜相机堵闭，上命兵侍郎嵇曾筠驰往协议。七月，决梁家营、詹家店，复遣大学士张鹏翮往协修，是月。九月，决郑州来童寨民堤，郑民挖武故堤，并冲决中牟杨桥官堤，寻。是岁建清东西束坝以御黄蓄清。二年，以嵇曾筠为副总河，驻武陟，辖河南河务，东河分治自此始。六月，决仪封大寨、兰板桥，逾月之。

于是各工并举。大挑清、烂泥浅引河四，及清至云梯关河，创筑关外束堤万八千馀丈，于家冈、武家墩大决十六，又筑兰、中牟、仪封、商丘月堤及虞城周家堤。明年，创建王家营、张家庄减坝二，筑周桥翟坝堤二十五里，加培家堰长堤，山、清、安三县黄河两岸及湖堰，大小决尽。优诏褒。十八年，建南岸砀山城铺、北岸大谷山减石坝各一，以杀上势。二十年，杨家庄，盖决五年矣。是岁增建邮南北坝八，徐州长樊大坝外月堤千六百八十九丈。

越二年，召询成龙曰：“减坝果可否？”对曰：“不宜，仍照辅所修而行。”上曰：“如此，何不早陈？尔排陷他人则易，任总河则难，非明验耶？”三十四年，成龙遭父忧，以漕督董安国代之。明年，大，决张家庄，河会丹、沁偪荥泽，徙治埠。又决安东童家营，湖。是岁筑拦黄大坝，于云梯关挑引河千二百馀丈，于关外家港导黄由南河东注海。去路不暢，上游易溃，而河患日亟。三十六年，决时家。明年，仍以成龙为河督。三十八年，上南巡，临视家堰等堤，谓诸臣曰：“治河上策，惟以浚河为要。河底浚，则洪泽湖直达黄河，兴化、盐城等七州县无汎滥之患，田产自然涸。若不治源，治终无裨益。今黄、淮会之过于径直，应将河、淮之堤各迤东湾曲拓筑，使之斜行会，则黄不致倒矣。”